Антропоидник ведет свое начало с Биологической станции, построенной в 1923 году в деревне Колтуши под Ленинградом. Основным направлением исследований было изучение физиологии больших полушарий головного мозга преимущественно собак методом условных рефлексов. С 1933 года добавилось изучение высшей нервной деятельности человекообразных обезьян.

В 1933 году сотрудник лаборатории и аспирант Павлова Петр Константинович Денисов привез из Франции двух шимпанзе — Розу и Рафаэля. Их поселили в специально выстроенном рядом с лабораторией антропоиднике.

В блокадное время антропоидник был эвакуирован в Казань, после войны вернулся обратно.

Начиная с 90-х годов государство практически прекратило финансирование антропоидника. В этот период усилиями энтузиастов-исследователей были сохранены питомцы и продолжено сравнительное изучение высшей нервной деятельности шимпанзе и детей дошкольного возраста.

По данным на июнь 2024 года, в антропоиднике продолжают исследования, например, следят за динамикой развития макак, формированием социальных отношений группы, исследуют когнитивные способности.